15년 전 갑자기 발생한 태양의 슈퍼 플레어가 지구를 뒤덮으면서, 각지에 잠들고 있던 수수께끼의 유물스파크 돌즈가 괴물로 변하는 사건이 전 세계에서 나타나고 있었다. 인류는 이에 대항하기 위해 특수방위팀 지오(Xio) 를 결성한다. 그리고 현재, 가장 빈번하게 괴물이 출현하는 일본에서 지오 대원이면서 괴물과 공존하는 것을 바라는 청년 강도현은 용철괴물 데마가와의 싸움에서 비밀의 빛 울트라맨 엑스와 만나고 그와 합체하게 되는 데...